在游戏的前奏中，玩家扮演主角Solid Snake，在一座被敌方势力占领的房屋中醒来。玩家需要学习控制方式，并逃离这个被敌人包围的地方。
Chapter 1: Shadow Moses Incident
在这一章节中，玩家进入Shadow Moses，开始调查并营救被劫持的重要人质。在此过程中，玩家还将与各种士兵和敌人进行战斗，并获得新的装备和武器。
Chapter 2: The Big Shell Incident
本章节发生在事件的几年之后。玩家将会扮演另一个角色Raiden，并进入名为"Big Shell"的大型海洋清洁设施。任务是寻找并拯救被绑架的总统。玩家需要与一个组织对抗，并解开隐藏在事件背后的真相。
Chapter 3: The Peace Walker Incident
在这一章节中，玩家将扮演Big Boss，组织一个特殊部队，以对抗一个意图引发全球核战争的组织。玩家将面临各种任务和挑战，需要发展基地并招募成员，最终阻止敌人的计划。
Chapter 4: The Phantom Pain
在这最终章节中，玩家再次扮演Big Boss，而这次的任务是追捕一个担心发动核战争的敌人组织。玩家将进行各种差事，包括潜入敌军基地、拯救俘虏和策划战略。同时，玩家还要应对自己受伤和心理创伤的后果。
Epilogue: The Legacy
游戏的结尾将呈现各种角色的命运和结局。这个章节将解答一些之前未解开的谜题，并向玩家展示游戏中各个角色的最终命运。
通过这个攻略，玩家能够了解《合金装备》系列游戏中主要剧情的顺序。注意，根据不同的版本和衍生作品，剧情可能有所不同，但以上顺序是一种常见的线性剧情顺序。
